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Identification of the ornithine decarboxylase gene in the putrescine-producer Oenococcus oeni BIFI-83

机译:腐胺生产者Oenococcus oeni BIFI-83中鸟氨酸脱羧酶基因的鉴定

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摘要

We report here the identification of an ornithine decarboxylase (ODC) gene in the putrescine-producer Oenococcus oeni BIFI-83\udstrain. The gene contains a 2,235-nucleotide open reading frame encoding a 745-amino acid residues protein with a deduced molecular\udmass of 81 kDa. The primary structure of the ODC deduced from the nucleotide sequence has a consensus sequence containing\udthe pyridoxal-5-phosphate (PLP) binding domain, and the critical amino acids residues involved in enzymatic activity are also conserved.\udAs determined by BLAST analysis, the deduced amino acid sequence of the odc gene shares a 67% identity with the ODC\udprotein from Lactobacillus 30a. The odc gene appears to be rarely present in the genome of O. oeni, since in a screening for the presence\udof this gene in 42 oenococcal strains none of the strains possessed an odc gene copy.
机译:我们在这里报告在腐胺生产者Oenococcus oeni BIFI-83 \ udstrain中的鸟氨酸脱羧酶(ODC)基因的鉴定。该基因包含一个2235个核苷酸的开放阅读框,该框架编码一个745个氨基酸残基的蛋白质,推导的分子质量为81 kDa。由核苷酸序列推导的ODC的一级结构具有一个共有序列,该共有序列包含\ udyoxal-5-磷酸(PLP)结合结构域,并且涉及酶活性的关键氨基酸残基也得以保守。 odc基因的推导氨基酸序列与乳酸杆菌30a的ODC \ ud蛋白具有67%的同一性。 odc基因似乎很少存在于o.oeni的基因组中,因为在筛选该基因在42种Oenococcal菌株中的存在\ udud时,没有一个菌株具有odc基因拷贝。

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